这种灾难片没有必要讨论拍摄的合理性，有这么多为了救治病人赶赴一线服务的英雄们，无论从电影还是现实，都是人类的骄傲。因为有了你们，人们才能度过这一个又一个没有没有办法防御的灾难。2011年3月11日14点46分左右，日本宫城县东北部由于海啸发生里氏8.8级特大地震，向那些一线的战士致敬，向受难者默哀！
新年伊始，某市立医院的急救医师松冈接下了一个急诊病患，病人高烧、痉挛、吐血、内脏
受损情况十分严重，但无法确诊是什么病，由于找不到有效的治疗方法，病人很快身亡。松冈还没有从一时的消沉中回过神来，事态却已经飞速升级。以同事安藤医生为首，一些医疗人员也染上了这种怪病，接着又波及到患者、外来人员。医院上上下下数不清的人被病毒感染，整所医院陷入了混乱。
世界卫生组织（WHO）派来小林荣子调查原因，并阻止感染扩大化。见到荣子后，松冈大为震动。原来两人本是一对恋人，由于荣子出国工作，他们才分道扬镳。荣子当机立断隔离整栋医院大楼，并要求医院收容新病人，采取优先治疗有希望病患的手段。松冈起先不赞成荣子雷厉风行缺乏人情味的出世作风，但渐渐为之所动，和她并肩作战。
病毒开始在日本全国蔓延，患者已达数千万，受灾状况已经超过了战争，交通网络瘫痪，城市机能停滞，日本社会面临崩溃，而一旦病毒蔓延至他国，全人类将迎来灭顶之灾。
在众人的努力下，确定病毒并非禽流感的变种，而是从另一封闭小岛所传。已被感染的小林大夫冒险尝试血清治疗，确实有效，治愈了多名患者，但小林大夫却无治身亡，松冈伤心不已。
在这个感染无处不在的国家里，经过全体人员的共同努力，半年后，终于研究出疫苗，病情得以控制，国家得以重建。